綜合科(行政審批科)。負責機關日常運轉工作。負責綜合協調機關工作;負責黨建、組織、人事、宣傳、統戰工作;負責法制、信訪穩定、社會治安綜合治理工作;負責重要會議組織,工作目標擬訂,管理制度修定完善和年度考核工作;負責公文、保密、人大代表意見、政協委員提案交辦、文書檔案管理工作;負責機關事務、國有資產管理、機關財務工作。

電子商務和信息化科。牽頭全區電子商務發展工作。負責擬訂和實施電子商務發展相關政策、規劃、措施。牽頭推進各行業電子商務擴大應用和行業管理，培育和引進電子商務市場主體，協調支持配送、支付、技術、認證等配套行業發展。推動電子商務服務體系建設，完善電子商務統計和評價體系。牽頭全區商務領域創新驅動及科技創新工作。負責商務系統信息化建設，推進商務領域大數據開發應用。負責機關信息化建設和管理。推進數字商務有關工作。完成上級交辦的其他工作。

開放經濟發展科(中新(重慶)戰略性互聯互通示范項目聯絡辦公室)。負責擬訂開放型經濟發展規劃、政策措施并組織實施。負責統籌全區對外貿易管理、對外貿易統計和運行情況分析。牽頭組織協調推進跨境電子商務國際合作。指導和組織實施對外貿易促進體系建設和對外貿易促進活動。負責國家外貿轉型升級基地（檸檬）、內外貿一體化建設。負責組織協調指導服務貿易促進工作。負責統籌中新示范項目建設相關工作。負責推動各開放平臺協同發展，協調做好海關監管場所建設、商檢、企業管理等關地合作。負責統籌融入西部陸海新通道建設、優化跨境貿易營商環境等口岸物流工作。負責推動中國（重慶）自由貿易試驗區潼南聯動創新區建設。負責現代服務業招商、外資招商，承擔外商投資統計工作。負責監督、檢查外商投資企業執行有關法律法規情況。負責外資政策咨詢、投訴協調等服務工作。負責擬訂和實施公民出境就業管理政策和赴境外就業人員權益保護工作。負責實施本區“走出去”戰略，推進本區企業國際產能合作。負責組織本區企業參與“一帶一路”沿線國家經濟合作。負責本區與香港、澳門特別行政區和臺灣地區經貿合作工作。負責組織參加境內境外重大展會活動。管理全區實施的國家對外援助業務。負責境外跨國公司地區總部和國內外企業在潼設立地區總部的協調服務。完成上級交辦的其他工作。

市場體系建設科。牽頭擬訂并組織實施全區商務發展戰略、發展規劃及相關行業規劃。統籌協調全區商務領域改革。牽頭統籌商務發展項目及商務領域重點項目建設。牽頭制定商品市場發展及商業網點規劃，推動完善現代商品市場體系。引導和促進農村流通和市場建設，構建城鄉一體的流通網絡體系。負責批發業行業管理，指導大宗產品批發市場建設，推進公益性農產品市場建設。牽頭促進農商對接，做好產銷銜接，搞活農產品流通。統籌對接鄉村振興、協同發展、城市品質提升行動計劃的實施。負責全區商務領域統計監測和綜合運行分析，組織協調解決商務經濟運行有關重大問題。牽頭擬訂全區重要生活消費品和重要商品應急保供政策措施、工作預案并組織實施。承擔突發性災害和突發性事件重要商品保供應急工作。牽頭推進實施“菜籃子”工程和軍民融合保障工作。承擔組織協調生活必需品的市場供應和市場調節工作。負責保供應急能力提升。負責培育全區保供應急主體企業，建立健全保供應急商品品類以及倉儲、運輸等設施設備、投放網絡體系。牽頭協調商務經濟運行風險管理和防控工作。負責組織、指導開展全區商務領域生活必需品保供應急演練。完成上級交辦的其他工作。

消費促進科。統籌全區商務領域消費促進工作，擬訂有關政策并組織實施。負責推進區域消費中心城市創建工作。指導商業業態調整，創新商業模式。承擔零售業行業管理工作，推進連鎖經營、代理、直銷、特許經營等。負責汽車流通（含二手車）行業流通經營的監督管理。負責商務領域節能降耗、綠色消費等工作。指導商圈、商品市場等商業設施建設與管理。擬訂全區生活性服務業發展戰略、規劃和政策并組織實施。開展生活性服務行業標準規范培訓和組織宣傳推廣。負責配合推進現代服務業發展工作。負責研究和推進生活性服務行業創新和發展模式，指導生活性服務行業開展品牌培育、設施打造、文化建設等工作。牽頭推進商務行業優質服務工作。負責推進城市社區商業優化發展。負責“老字號”發展與保護工作。擬訂全區會展經濟發展規劃和政策措施。統籌協調全區黨政機關展會活動的報批、審核和社會化展會活動的備案工作。負責統計和分析全區會展業發展情況，負責全區品牌展會活動的培育。負責區內、本區外出、外地來區舉辦的大型展會的統籌協調工作。負責統籌、推介全區會展營商環境和宣傳工作。指導、監督商貿領域各類展會促銷活動。完成上級交辦的其他工作。

市場流通科。牽頭擬訂規范流通秩序的政策措施，組織開展商務領域市場秩序整治。負責職責范圍內商務領域行政執法，受理商務舉報投訴，協調行業監管綜合執法，參與打擊商業欺詐等工作。負責擬訂實施全區物流發展規劃及促進政策。協調、指導全區物流產業發展工作。研究分析物流業發展的重大問題。牽頭商務物流標準化體系和智慧物流配送體系建設，負責全區城鄉物流配送體系建設、電商物流、冷鏈行業管理和倉儲發展等工作。牽頭推動商貿領域信用建設。統籌協調全區商務領域創業就業相關工作，指導商務行業技能技術培訓。負責拍賣、再生資源回收、舊貨流通、老舊汽車更新、報廢機動車回收拆解等行業管理工作。牽頭擬訂藥品流通發展規劃和政策。牽頭商務領域生態環保工作。統籌流通環節供應鏈體系試點工作，負責推進現代供應鏈應用與創新。負責指導商貿行業安全生產工作，配合有關部門做好商貿行業安全生產監督管理工作。牽頭指導督促商貿、流通企業貫徹執行安全生產法律法規，防災減災、風險管理和管控工作。按規定權限擬訂全區加油站發展規劃、布局，對成品油流通進行監督管理，負責成品油經營、儲存日常安全監督管理。制定安全生產年度監督檢查計劃，負責職責范圍內行業領域安全生產違法行為的行政處罰。完成上級交辦的其他工作。